More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4052 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 281 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  71.83 
 
 		 295 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 576 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  60 
 
 		 554 aa  292  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  60.92 
 
 		 264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  60.08 
 
 		 549 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  59.3 
 
 		 551 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  59.3 
 
 		 551 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  59.07 
 
 		 569 aa  275  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  57.92 
 
 		 547 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  42.02 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  41.22 
 
 		 287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  40.15 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  43.02 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  41.18 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  38.95 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  37.64 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  35.77 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  34.77 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  39.32 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  39.32 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  38.33 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  37.74 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  39.67 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  33.59 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  32.78 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 		 262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  28.35 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  30.11 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  30.26 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  27.39 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  26.56 
 
 		 263 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  30.97 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  26.01 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  31.28 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  29.52 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  27.98 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  28.52 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  29.9 
 
 		 247 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  23.74 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>