121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6292 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  77.66 
 
 
554 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  77.91 
 
 
498 aa  757    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  78.51 
 
 
536 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  79.26 
 
 
476 aa  716    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  75.7 
 
 
500 aa  743    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  73 
 
 
523 aa  709    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  75.7 
 
 
500 aa  743    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  77.22 
 
 
554 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  78.63 
 
 
554 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  100 
 
 
498 aa  1018    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  76.1 
 
 
500 aa  729    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  76.41 
 
 
512 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  75.3 
 
 
501 aa  748    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  77.21 
 
 
486 aa  718    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  65.01 
 
 
470 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  65.01 
 
 
470 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  52.56 
 
 
479 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  51.14 
 
 
477 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  50.68 
 
 
481 aa  458  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  51.76 
 
 
466 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  50.92 
 
 
465 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  50.92 
 
 
465 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  42.32 
 
 
488 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  41.78 
 
 
488 aa  349  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  40.48 
 
 
475 aa  346  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  40.36 
 
 
485 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  43.68 
 
 
475 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  43.09 
 
 
475 aa  342  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  40.44 
 
 
483 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  39.82 
 
 
485 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  41.63 
 
 
543 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  41.11 
 
 
535 aa  332  9e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  42.54 
 
 
472 aa  331  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  41.12 
 
 
535 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  40.43 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  40 
 
 
486 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  38.84 
 
 
486 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  41.79 
 
 
476 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  39.83 
 
 
476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  41.06 
 
 
475 aa  310  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  41.3 
 
 
472 aa  310  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  41.04 
 
 
482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  41.35 
 
 
487 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  39.73 
 
 
470 aa  296  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  39.78 
 
 
483 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  37.91 
 
 
488 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  38.73 
 
 
477 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  38.41 
 
 
477 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  36.98 
 
 
475 aa  243  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  34.29 
 
 
399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  29.13 
 
 
547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  29.56 
 
 
493 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  33.11 
 
 
438 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  28.98 
 
 
453 aa  121  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  22.67 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.97 
 
 
482 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 
432 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 
432 aa  60.1  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 
416 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.56 
 
 
437 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.65 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 
394 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  22.67 
 
 
426 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.1 
 
 
488 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 
440 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  22.45 
 
 
408 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 
438 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 
473 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.56 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
435 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 
431 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  23.83 
 
 
458 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.03 
 
 
434 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 
432 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  25 
 
 
418 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
437 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 
438 aa  50.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  23.55 
 
 
414 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  21.3 
 
 
492 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  19.94 
 
 
409 aa  49.3  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.49 
 
 
501 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0872  Outer membrane protein-like  24.15 
 
 
517 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  24.91 
 
 
418 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 
423 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  25 
 
 
416 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.36 
 
 
441 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  21.52 
 
 
472 aa  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.8 
 
 
472 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  24.56 
 
 
428 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.04 
 
 
478 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  22.94 
 
 
479 aa  47.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.5 
 
 
470 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.81 
 
 
428 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>