More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4220 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4220  histidine kinase  100 
 
 
478 aa  938    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4962  histidine kinase  71.67 
 
 
481 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3198  histidine kinase  71.67 
 
 
481 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
484 aa  203  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4281  histidine kinase  36.31 
 
 
514 aa  181  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1205  histidine kinase  34.56 
 
 
548 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2790  histidine kinase  36.48 
 
 
499 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12989  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1551  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
529 aa  170  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573003  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
871 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
680 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1620  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
559 aa  136  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.96029  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0922  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
727 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
870 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2138  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
351 aa  133  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
398 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
845 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.22 
 
 
857 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2129  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
862 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0772387  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
708 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 
759 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
608 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
842 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1645  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
810 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
857 aa  123  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
858 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.32 
 
 
1822 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
461 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
683 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  34.23 
 
 
355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
553 aa  120  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  32.78 
 
 
483 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
501 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
618 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
551 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  33.07 
 
 
1833 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
902 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
848 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.664527  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  33.6 
 
 
355 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3795  histidine kinase  31.99 
 
 
610 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
1000 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
848 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
857 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.897717  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
975 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2126  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
848 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465456  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
634 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  36.86 
 
 
616 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  34.51 
 
 
666 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  34.51 
 
 
630 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  33.61 
 
 
356 aa  115  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  34.51 
 
 
666 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
672 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  35.27 
 
 
669 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
677 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
634 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  31.98 
 
 
594 aa  113  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  34.38 
 
 
669 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6679  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
658 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
669 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
669 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  39.33 
 
 
665 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  30 
 
 
357 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  33.93 
 
 
667 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
799 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
845 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0810932  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  35.55 
 
 
668 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
1211 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  32.64 
 
 
1092 aa  111  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
510 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
838 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
838 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
838 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
630 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
672 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
838 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.49 
 
 
643 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
838 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
506 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
733 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  37.66 
 
 
615 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  36.49 
 
 
643 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
683 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
635 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2281  histidine kinase  32.73 
 
 
558 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.278764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
846 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145258  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
635 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
498 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  36.49 
 
 
643 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
634 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
628 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
838 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
512 aa  110  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
851 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
692 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4081 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2094  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
503 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  32.3 
 
 
600 aa  110  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>