129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0741 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  33.5 
 
 		 1426 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  74.8 
 
 		 1368 aa  2005    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  74.62 
 
 		 1397 aa  2046    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  94.92 
 
 		 1399 aa  2644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  75.7 
 
 		 1397 aa  2063    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  60.2 
 
 		 1430 aa  1644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  99.93 
 
 		 1399 aa  2781    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  92.21 
 
 		 1398 aa  2563    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  100 
 
 		 1399 aa  2781    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  74.55 
 
 		 1397 aa  2041    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  74.55 
 
 		 1397 aa  2041    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  74.55 
 
 		 1397 aa  2043    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  74.55 
 
 		 1397 aa  2044    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  74.8 
 
 		 1372 aa  2004    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  87.78 
 
 		 1399 aa  2452    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  99.5 
 
 		 1399 aa  2771    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  92.14 
 
 		 1398 aa  2564    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  55.98 
 
 		 1419 aa  1563    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  60.06 
 
 		 1428 aa  1608    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  32.71 
 
 		 1419 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1426 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  31.12 
 
 		 1426 aa  629  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1398 aa  592  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1381 aa  545  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1425 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1384 aa  503  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1420 aa  489  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1378 aa  487  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1379 aa  476  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1394 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1307 aa  439  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  29.48 
 
 		 1472 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  25.02 
 
 		 1384 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1341 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1284 aa  405  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1264 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  29.23 
 
 		 1450 aa  399  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  23.6 
 
 		 1379 aa  365  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1261 aa  353  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1418 aa  284  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  27.31 
 
 		 1304 aa  217  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  20.96 
 
 		 1273 aa  201  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  20.54 
 
 		 1273 aa  200  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1277 aa  200  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1284 aa  191  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1288 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1276 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1141 aa  182  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1276 aa  173  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  25.6 
 
 		 1300 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1291 aa  166  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1291 aa  166  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1392 aa  165  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1419 aa  163  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1436 aa  162  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1283 aa  161  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1309 aa  157  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1287 aa  156  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  21.1 
 
 		 1266 aa  155  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1266 aa  155  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1286 aa  153  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1266 aa  153  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.79 
 
 		 1266 aa  151  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1266 aa  151  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1459 aa  151  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1274 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1266 aa  151  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1266 aa  150  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1443 aa  149  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1441 aa  149  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.79 
 
 		 1266 aa  147  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1266 aa  147  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1266 aa  147  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1307 aa  147  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1390 aa  146  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1454 aa  146  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1383 aa  145  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1446 aa  145  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1307 aa  144  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1306 aa  144  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  21.09 
 
 		 1301 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  22.55 
 
 		 1301 aa  143  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1305 aa  142  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  24.65 
 
 		 1346 aa  140  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1417 aa  138  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  22.01 
 
 		 1416 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1439 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1417 aa  133  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1265 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  23.06 
 
 		 1273 aa  129  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1269 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  22.78 
 
 		 1331 aa  129  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1266 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1266 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1266 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1266 aa  127  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1266 aa  127  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1271 aa  126  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21.83 
 
 		 1323 aa  124  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>