205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3557 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 458 aa  921    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  30.5 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  29.59 
 
 		 437 aa  166  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 		 422 aa  163  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 432 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  31.38 
 
 		 435 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  27.97 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 		 429 aa  156  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  29.81 
 
 		 442 aa  154  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.21 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  29.54 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 428 aa  146  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.84 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 453 aa  143  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.22 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.02 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 452 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 424 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.7 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 436 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 433 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 430 aa  99.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 434 aa  90.1  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  32.4 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  22.01 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.07 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.01 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  21.88 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  21.76 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  28.11 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.81 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  22.65 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  22.68 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  21.88 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  21.91 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  21.84 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0063  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 475 aa  57  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 423 aa  57  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 419 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.93 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  22.58 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.98 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  32.33 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  21.34 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.09 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>