78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3389 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  100 
 
 		 1260 aa  2511    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  49.5 
 
 		 1242 aa  93.6  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  47.06 
 
 		 1331 aa  88.6  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  22.6 
 
 		 670 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  42.11 
 
 		 1577 aa  75.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  41.67 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  22.3 
 
 		 657 aa  65.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  37.93 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  27.47 
 
 		 896 aa  62.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  27.47 
 
 		 908 aa  62  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  26.7 
 
 		 460 aa  62  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  26.7 
 
 		 653 aa  61.6  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  35.11 
 
 		 453 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  35.11 
 
 		 449 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  35.11 
 
 		 453 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 868 aa  61.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  35.11 
 
 		 453 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  35.11 
 
 		 453 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  28.93 
 
 		 868 aa  61.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  36.78 
 
 		 451 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  35.11 
 
 		 453 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  35.11 
 
 		 453 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  26.92 
 
 		 896 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  35.11 
 
 		 504 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  35.63 
 
 		 451 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 868 aa  60.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  24.92 
 
 		 906 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  29.03 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  35.63 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  35.63 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  35.63 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  31 
 
 		 867 aa  59.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  32.93 
 
 		 869 aa  58.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  26.21 
 
 		 985 aa  57  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  30.67 
 
 		 540 aa  57.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  30.21 
 
 		 863 aa  57  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  31.68 
 
 		 968 aa  56.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  32.38 
 
 		 675 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  28.71 
 
 		 623 aa  55.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3077  hypothetical protein  23.23 
 
 		 712 aa  55.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  31.88 
 
 		 627 aa  55.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  28.71 
 
 		 634 aa  55.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  25.63 
 
 		 668 aa  55.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  25.62 
 
 		 868 aa  55.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  34.78 
 
 		 563 aa  54.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  25.62 
 
 		 868 aa  54.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0488  heparinase II/III family protein  24.66 
 
 		 761 aa  52.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  32.46 
 
 		 848 aa  52.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.17 
 
 		 3197 aa  52.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  45.45 
 
 		 792 aa  52.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  24.79 
 
 		 868 aa  51.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4737  hypothetical protein  34.65 
 
 		 214 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.82 
 
 		 699 aa  51.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  52.38 
 
 		 729 aa  50.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1892  hypothetical protein  33.86 
 
 		 214 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.957451 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  30.7 
 
 		 481 aa  50.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.5 
 
 		 669 aa  50.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  52.38 
 
 		 729 aa  50.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  44.68 
 
 		 855 aa  50.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2625  hypothetical protein  31.86 
 
 		 2311 aa  50.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  34.55 
 
 		 1057 aa  49.7  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  43.48 
 
 		 772 aa  50.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  47.62 
 
 		 816 aa  49.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 		 727 aa  49.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  55.26 
 
 		 420 aa  48.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  23.75 
 
 		 560 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  46.51 
 
 		 443 aa  48.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  25.98 
 
 		 3197 aa  48.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1969  hypothetical protein  23.57 
 
 		 760 aa  46.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  31.2 
 
 		 543 aa  46.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  42.59 
 
 		 402 aa  46.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  43.9 
 
 		 296 aa  45.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  49.02 
 
 		 545 aa  45.8  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  19.47 
 
 		 630 aa  45.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0331  Heparinase II/III family protein  41.94 
 
 		 1005 aa  45.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  46.34 
 
 		 395 aa  45.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1169  Heparinase II/III family protein  26.18 
 
 		 870 aa  45.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  35.29 
 
 		 1053 aa  44.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>