41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3797 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  100 
 
 
670 aa  1394    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  21.82 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  24.25 
 
 
668 aa  95.1  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  22.6 
 
 
1260 aa  87  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  20.3 
 
 
672 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  25.27 
 
 
561 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3077  hypothetical protein  22.01 
 
 
712 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  26.62 
 
 
557 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  19.55 
 
 
672 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  23.05 
 
 
630 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  29.73 
 
 
968 aa  72.8  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  20.94 
 
 
630 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  24.17 
 
 
528 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  19.25 
 
 
651 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  28.39 
 
 
541 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  21.65 
 
 
675 aa  69.3  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  23.38 
 
 
634 aa  69.3  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  20.37 
 
 
651 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  19.38 
 
 
906 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  22.04 
 
 
896 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  22.48 
 
 
603 aa  65.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  21.19 
 
 
702 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  22.36 
 
 
908 aa  64.7  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  22.04 
 
 
896 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  22.34 
 
 
702 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  20.76 
 
 
702 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  25.42 
 
 
550 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  33.59 
 
 
547 aa  55.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  20.63 
 
 
627 aa  54.7  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  22.48 
 
 
545 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0680  heparinase II/III-like  22.09 
 
 
738 aa  48.5  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  20.86 
 
 
587 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  26.07 
 
 
766 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  20.59 
 
 
627 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  25 
 
 
680 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2808  hypothetical protein  26.14 
 
 
504 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0791848  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1124  Heparinase II/III family protein  22.86 
 
 
616 aa  44.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  27.62 
 
 
617 aa  44.7  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1388  hypothetical protein  20.34 
 
 
609 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.210626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3705  hypothetical protein  24.58 
 
 
557 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.483181  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  22.58 
 
 
524 aa  44.3  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>