48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3793 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  100 
 
 
627 aa  1298    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  30.95 
 
 
668 aa  317  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  24.58 
 
 
630 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  23.23 
 
 
627 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  29.96 
 
 
702 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  29.76 
 
 
702 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  30 
 
 
702 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  26.68 
 
 
630 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  23.19 
 
 
675 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  25.53 
 
 
651 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  24.7 
 
 
651 aa  122  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1124  Heparinase II/III family protein  26.68 
 
 
616 aa  110  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02344  hypothetical protein  25.79 
 
 
612 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  27.87 
 
 
587 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  25.72 
 
 
680 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  25.3 
 
 
550 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  25.65 
 
 
547 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  24.31 
 
 
541 aa  92.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  26.51 
 
 
557 aa  90.5  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  28.29 
 
 
766 aa  84  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  24.1 
 
 
561 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1969  hypothetical protein  24.43 
 
 
760 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  21.21 
 
 
600 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  31.79 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  20.82 
 
 
672 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  21.14 
 
 
657 aa  65.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  21.04 
 
 
672 aa  64.3  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  22.44 
 
 
906 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  32.56 
 
 
545 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  20.31 
 
 
634 aa  60.1  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  34.04 
 
 
594 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  29.07 
 
 
524 aa  57  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  31.88 
 
 
1260 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  37.84 
 
 
617 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  30.46 
 
 
592 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  22.3 
 
 
603 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3077  hypothetical protein  22.57 
 
 
712 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  26.32 
 
 
569 aa  50.4  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  27.82 
 
 
968 aa  50.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  23.08 
 
 
584 aa  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0251  heparinase II/III-like  27.78 
 
 
772 aa  47  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.884612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  25.16 
 
 
584 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  25.83 
 
 
572 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  20.59 
 
 
670 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  21.43 
 
 
908 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  21.43 
 
 
896 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  20 
 
 
896 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  25.22 
 
 
1092 aa  44.3  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>