17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4737 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4737  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1892  hypothetical protein  87.32 
 
 		 214 aa  383  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.957451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2501  hypothetical protein  43.82 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  39.49 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2522  hypothetical protein  35.76 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  36.3 
 
 		 1062 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1872  hypothetical protein  38.53 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2227  hypothetical protein  36.44 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2675  hypothetical protein  29.1 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.912699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2526  hypothetical protein  45.16 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.26 
 
 		 1037 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  34.65 
 
 		 1260 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  26.17 
 
 		 713 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 3197 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  35.05 
 
 		 340 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  42.37 
 
 		 831 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.01 
 
 		 3197 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>