13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2522 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2522  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  41.03 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2501  hypothetical protein  41.83 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1892  hypothetical protein  34.15 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.957451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4737  hypothetical protein  36.81 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2675  hypothetical protein  36.92 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.912699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2227  hypothetical protein  36.8 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  26.44 
 
 		 1062 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2504  hypothetical protein  29.17 
 
 		 255 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0217  heat shock protein DnaJ domain protein  28.42 
 
 		 412 aa  44.7  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1839  hypothetical protein  27.56 
 
 		 262 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0854  hypothetical protein  23.53 
 
 		 419 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0320102  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2625  hypothetical protein  32.73 
 
 		 2311 aa  41.6  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>