14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2227 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2227  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2675  hypothetical protein  47.3 
 
 		 242 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.912699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  33.01 
 
 		 1062 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  31.84 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2501  hypothetical protein  40.15 
 
 		 189 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2522  hypothetical protein  36.8 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.41 
 
 		 1037 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1892  hypothetical protein  37.29 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.957451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4737  hypothetical protein  36.44 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3372  hypothetical protein  37.97 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3370  hypothetical protein  37.97 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.0308519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1839  hypothetical protein  31.58 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2623  hypothetical protein  30.56 
 
 		 216 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2504  hypothetical protein  31.58 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>