44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3022 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  100 
 
 
657 aa  1372    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  30.87 
 
 
672 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  30.87 
 
 
672 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  26.18 
 
 
634 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0124  Heparinase II/III family protein  26.74 
 
 
594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  21.82 
 
 
670 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  24.17 
 
 
651 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  25.55 
 
 
651 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  26.39 
 
 
668 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  26.2 
 
 
603 aa  99  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  23.75 
 
 
630 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  23.87 
 
 
906 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  24.79 
 
 
675 aa  84  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  23.91 
 
 
557 aa  82  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  22.98 
 
 
702 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  22.98 
 
 
702 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  21.82 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3705  hypothetical protein  23.26 
 
 
557 aa  77.4  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.483181  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  24.49 
 
 
908 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  24.49 
 
 
896 aa  77  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  24.77 
 
 
896 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  20.5 
 
 
587 aa  74.3  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  21.81 
 
 
561 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  26.85 
 
 
968 aa  72.4  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  24.46 
 
 
702 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  23.79 
 
 
627 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  23.51 
 
 
528 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  22.3 
 
 
1260 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  22.02 
 
 
541 aa  65.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  21.14 
 
 
627 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  23.79 
 
 
545 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  21.83 
 
 
1188 aa  60.1  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  23.23 
 
 
630 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  21.18 
 
 
550 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  21.51 
 
 
547 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  21.7 
 
 
680 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1166  Heparinase II/III family protein  24.38 
 
 
741 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.307073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  23.76 
 
 
594 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  24.43 
 
 
600 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  23.94 
 
 
672 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3077  hypothetical protein  20.43 
 
 
712 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  23.94 
 
 
672 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  23.94 
 
 
672 aa  46.2  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  35.23 
 
 
766 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>