19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1969 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1969  hypothetical protein  100 
 
 
760 aa  1543    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  24.43 
 
 
627 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  22.05 
 
 
651 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  28.06 
 
 
702 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  21.45 
 
 
668 aa  70.9  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  27.74 
 
 
702 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  27.65 
 
 
702 aa  67.4  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  22.63 
 
 
651 aa  67  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  22.53 
 
 
630 aa  63.9  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  22.27 
 
 
630 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  21.13 
 
 
675 aa  61.2  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  23.18 
 
 
627 aa  54.7  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  21.64 
 
 
603 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  21.29 
 
 
634 aa  52  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  24.57 
 
 
561 aa  52  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  24.16 
 
 
557 aa  51.6  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  24.11 
 
 
672 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  23.57 
 
 
1260 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  21.01 
 
 
672 aa  45.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>