19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8037 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  100 
 
 
560 aa  1154    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3705  hypothetical protein  55.96 
 
 
557 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.483181  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2808  hypothetical protein  66.82 
 
 
504 aa  309  8e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0791848  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  23.77 
 
 
908 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  23.77 
 
 
896 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  23.77 
 
 
896 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  23.12 
 
 
906 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  21.82 
 
 
657 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0680  heparinase II/III-like  24.66 
 
 
738 aa  76.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  24.39 
 
 
1188 aa  61.6  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  20.5 
 
 
672 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  19.71 
 
 
672 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  21.75 
 
 
603 aa  54.3  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1388  hypothetical protein  23.42 
 
 
609 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.210626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6521  heparinase II/III family protein  23.57 
 
 
874 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0494474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  22.95 
 
 
561 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  23.75 
 
 
1260 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0595  hypothetical protein  22.98 
 
 
888 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.395193 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  27.69 
 
 
968 aa  45.8  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>