30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0402 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  100 
 
 		 672 aa  1368    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  96.13 
 
 		 672 aa  1321    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  31.47 
 
 		 634 aa  319  7.999999999999999e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  30.87 
 
 		 657 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0124  Heparinase II/III family protein  31.89 
 
 		 594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  24.04 
 
 		 627 aa  108  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  26.58 
 
 		 651 aa  94.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  27 
 
 		 651 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  19.55 
 
 		 670 aa  77.8  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  19.23 
 
 		 668 aa  75.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  21.54 
 
 		 675 aa  73.9  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  23.18 
 
 		 557 aa  69.7  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  24.48 
 
 		 896 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  24.48 
 
 		 908 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  24.48 
 
 		 896 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  21.04 
 
 		 627 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  25.94 
 
 		 968 aa  63.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  26.04 
 
 		 603 aa  63.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  24.46 
 
 		 600 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  25.13 
 
 		 630 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  22.82 
 
 		 547 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  23.56 
 
 		 528 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  21.83 
 
 		 630 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3705  hypothetical protein  18.52 
 
 		 557 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.483181  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  19.71 
 
 		 560 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  21.46 
 
 		 906 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  24.24 
 
 		 680 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  20.49 
 
 		 561 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1969  hypothetical protein  21.01 
 
 		 760 aa  45.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  21.63 
 
 		 1188 aa  44.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>