76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0392 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  100 
 
 
557 aa  1150    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  46.93 
 
 
541 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  45.49 
 
 
547 aa  464  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  45.79 
 
 
550 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  40.9 
 
 
561 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  36.02 
 
 
528 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  31.11 
 
 
545 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  33.79 
 
 
587 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  37.35 
 
 
680 aa  210  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  27.13 
 
 
651 aa  173  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  26.69 
 
 
651 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  29.98 
 
 
594 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  26.78 
 
 
603 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  27.94 
 
 
600 aa  144  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  36.68 
 
 
617 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  28.45 
 
 
524 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  24.2 
 
 
668 aa  106  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  25.34 
 
 
568 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  25.85 
 
 
518 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  27.97 
 
 
610 aa  95.9  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  29.25 
 
 
597 aa  94  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  25.78 
 
 
548 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  26.25 
 
 
570 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  26.46 
 
 
570 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  27.11 
 
 
629 aa  91.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  24.95 
 
 
570 aa  92  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  27.33 
 
 
572 aa  91.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  24.77 
 
 
548 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  26.51 
 
 
627 aa  90.5  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  26.44 
 
 
569 aa  89.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  27.73 
 
 
568 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  24.46 
 
 
569 aa  88.6  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  27.52 
 
 
614 aa  87.4  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  24.4 
 
 
581 aa  86.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  25.91 
 
 
584 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  27.64 
 
 
584 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  28.28 
 
 
584 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  26.81 
 
 
571 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  26.56 
 
 
592 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  26.81 
 
 
584 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  23.91 
 
 
657 aa  82  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  25.96 
 
 
573 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  26.34 
 
 
573 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  26.62 
 
 
670 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  20.29 
 
 
630 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  20.89 
 
 
627 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  27.67 
 
 
628 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  25.62 
 
 
543 aa  74.7  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  28.12 
 
 
584 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  25.9 
 
 
617 aa  74.7  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  25.9 
 
 
580 aa  73.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  26.58 
 
 
628 aa  73.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  24.46 
 
 
581 aa  72.8  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  25.58 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  23.18 
 
 
672 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  23.18 
 
 
672 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  21.72 
 
 
630 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  26.55 
 
 
702 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  26.55 
 
 
702 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  25.42 
 
 
575 aa  63.9  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  26.95 
 
 
582 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  26.65 
 
 
702 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  24.16 
 
 
592 aa  61.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  24.24 
 
 
567 aa  60.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  24.24 
 
 
567 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  29.17 
 
 
766 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3077  hypothetical protein  25.61 
 
 
712 aa  57.4  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  22.84 
 
 
908 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  22.84 
 
 
896 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  22.3 
 
 
896 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  22.97 
 
 
906 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  26.58 
 
 
1188 aa  54.3  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  26.45 
 
 
968 aa  52.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1969  hypothetical protein  24.16 
 
 
760 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3408  hypothetical protein  33.96 
 
 
488 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  20.21 
 
 
634 aa  46.2  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>