22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3705 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  55.96 
 
 		 560 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3705  hypothetical protein  100 
 
 		 557 aa  1122    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.483181  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2808  hypothetical protein  53.57 
 
 		 504 aa  253  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  24.02 
 
 		 908 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  24.02 
 
 		 896 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  24.02 
 
 		 896 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  24.43 
 
 		 906 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  27.73 
 
 		 1188 aa  77.8  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  23.26 
 
 		 657 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  22.35 
 
 		 603 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0680  heparinase II/III-like  24.44 
 
 		 738 aa  60.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  18.52 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  19.15 
 
 		 672 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1388  hypothetical protein  23.45 
 
 		 609 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0595  hypothetical protein  24.41 
 
 		 888 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.395193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  24.21 
 
 		 545 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  28.97 
 
 		 968 aa  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  24.34 
 
 		 594 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  22.55 
 
 		 550 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  24.58 
 
 		 670 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  26.42 
 
 		 617 aa  43.9  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  29.57 
 
 		 618 aa  43.9  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>