41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0460 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  100 
 
 		 627 aa  1248    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  25.08 
 
 		 668 aa  183  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  23.23 
 
 		 627 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  24.96 
 
 		 675 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  26.02 
 
 		 630 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  24.48 
 
 		 672 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  24.04 
 
 		 672 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  25 
 
 		 634 aa  89.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  22.38 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  22.81 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  20.89 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  24.86 
 
 		 545 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  21.78 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  18.71 
 
 		 680 aa  73.9  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  23.79 
 
 		 657 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  20.25 
 
 		 702 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1124  Heparinase II/III family protein  18.82 
 
 		 616 aa  70.9  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  21.37 
 
 		 561 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  23.28 
 
 		 630 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  24.63 
 
 		 541 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  20.62 
 
 		 702 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  19.1 
 
 		 603 aa  67.8  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  20.73 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  25.45 
 
 		 968 aa  64.7  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  19.21 
 
 		 702 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  25.95 
 
 		 600 aa  60.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
NC_003296  RS02344  hypothetical protein  19.46 
 
 		 612 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  24.86 
 
 		 594 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  21.43 
 
 		 651 aa  60.1  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  20.67 
 
 		 651 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  37.66 
 
 		 617 aa  57.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  20.63 
 
 		 670 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1969  hypothetical protein  23.18 
 
 		 760 aa  54.7  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  22.2 
 
 		 896 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  19.53 
 
 		 766 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0680  heparinase II/III-like  24.83 
 
 		 738 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  22.2 
 
 		 896 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  22.2 
 
 		 908 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11508  putative chondroitin AC/alginate lyase  22.8 
 
 		 759 aa  51.2  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0906796  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0124  Heparinase II/III family protein  22.27 
 
 		 594 aa  45.8  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3651  heparinase II/III-like  28.06 
 
 		 748 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>