59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1300 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  100 
 
 
680 aa  1328    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  48.18 
 
 
587 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  34.48 
 
 
557 aa  212  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  30.42 
 
 
541 aa  194  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  31.83 
 
 
545 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  27.27 
 
 
651 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  26.38 
 
 
651 aa  160  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  31 
 
 
561 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  32.12 
 
 
550 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  30.19 
 
 
547 aa  150  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  26.2 
 
 
600 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  27.78 
 
 
603 aa  135  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  28.73 
 
 
528 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  31.25 
 
 
594 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  28.69 
 
 
617 aa  102  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  28.48 
 
 
627 aa  98.2  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  29.28 
 
 
524 aa  83.2  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  18.37 
 
 
627 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  31.18 
 
 
668 aa  72.8  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  29.62 
 
 
597 aa  70.5  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  19.5 
 
 
630 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  27.66 
 
 
629 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  26.71 
 
 
584 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  26.2 
 
 
518 aa  66.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  27.27 
 
 
628 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  25.92 
 
 
584 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  24.73 
 
 
569 aa  63.9  0.000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  24.95 
 
 
592 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  26.81 
 
 
580 aa  63.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  26.41 
 
 
584 aa  61.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  28.75 
 
 
570 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  26.09 
 
 
543 aa  58.5  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  26.09 
 
 
617 aa  58.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  21.7 
 
 
657 aa  57.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  25.93 
 
 
584 aa  57.8  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  27.89 
 
 
570 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  29.88 
 
 
702 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  28.43 
 
 
570 aa  57  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  27.63 
 
 
610 aa  57  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  27.32 
 
 
702 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  29.63 
 
 
702 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  26.33 
 
 
569 aa  54.7  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  26.32 
 
 
568 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  26.91 
 
 
571 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  24.32 
 
 
568 aa  51.2  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  24.52 
 
 
634 aa  50.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  26.19 
 
 
573 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  25.86 
 
 
614 aa  48.5  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  30.9 
 
 
575 aa  48.5  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  24.24 
 
 
672 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  24.4 
 
 
548 aa  47.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  25.13 
 
 
548 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3077  hypothetical protein  27.87 
 
 
712 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_003296  RS02344  hypothetical protein  29.94 
 
 
612 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  26.32 
 
 
573 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  27.2 
 
 
968 aa  45.8  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  25 
 
 
670 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  20.25 
 
 
906 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  23.81 
 
 
672 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>