27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4034 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  100 
 
 
630 aa  1314    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  29.71 
 
 
675 aa  309  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1124  Heparinase II/III family protein  30.25 
 
 
616 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02344  hypothetical protein  32.08 
 
 
612 aa  200  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  26.68 
 
 
627 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  22.6 
 
 
668 aa  110  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  23.45 
 
 
630 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  24.12 
 
 
702 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  24.57 
 
 
702 aa  107  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  23.91 
 
 
702 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  23.85 
 
 
603 aa  80.1  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  23.99 
 
 
561 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  23.05 
 
 
670 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  24.4 
 
 
766 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  23.28 
 
 
627 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  21.72 
 
 
557 aa  67.8  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  20.71 
 
 
651 aa  64.7  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1969  hypothetical protein  22.27 
 
 
760 aa  63.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  21.97 
 
 
547 aa  63.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  22.05 
 
 
528 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  21.83 
 
 
672 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  21.03 
 
 
651 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  23.23 
 
 
657 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  21.83 
 
 
672 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0680  heparinase II/III-like  26.85 
 
 
738 aa  56.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  24.62 
 
 
968 aa  55.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  21.27 
 
 
541 aa  53.9  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>