40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1481 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  95.73 
 
 
702 aa  1120    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  98.86 
 
 
702 aa  1312    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  100 
 
 
702 aa  1324    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  24.8 
 
 
630 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  30.3 
 
 
627 aa  163  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  26.88 
 
 
668 aa  146  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  20.29 
 
 
675 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  23.14 
 
 
651 aa  112  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  22.64 
 
 
651 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  23.91 
 
 
630 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_003296  RS02344  hypothetical protein  28.04 
 
 
612 aa  98.2  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  27.33 
 
 
766 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1124  Heparinase II/III family protein  28.46 
 
 
616 aa  84  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  22.65 
 
 
657 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  20.24 
 
 
627 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1969  hypothetical protein  27.74 
 
 
760 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  24.44 
 
 
541 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  26.55 
 
 
557 aa  67  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  20.91 
 
 
670 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  23.39 
 
 
603 aa  61.2  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  34.19 
 
 
561 aa  58.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  22.71 
 
 
547 aa  57.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  26.49 
 
 
587 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  29.68 
 
 
680 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  31.55 
 
 
584 aa  54.3  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  36.13 
 
 
617 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0680  heparinase II/III-like  33.56 
 
 
738 aa  53.9  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  30.77 
 
 
545 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  29.05 
 
 
594 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  31.36 
 
 
592 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  31.78 
 
 
628 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  30.43 
 
 
571 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  30.87 
 
 
550 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  32.79 
 
 
568 aa  47.4  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  37.36 
 
 
528 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3077  hypothetical protein  27.39 
 
 
712 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  26.02 
 
 
672 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  26.02 
 
 
672 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  26.02 
 
 
672 aa  45.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  26.03 
 
 
568 aa  44.3  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>