23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3711 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  99.85 
 
 
672 aa  1399    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  100 
 
 
672 aa  1400    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  99.55 
 
 
672 aa  1395    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0489  heparinase II/III family protein  24.01 
 
 
622 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3284  hypothetical protein  25.05 
 
 
736 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.924939  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3651  heparinase II/III-like  22.94 
 
 
748 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324454  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46500  alginate lyase  24.07 
 
 
742 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481088  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3104  heparinase II/III family protein  25.38 
 
 
760 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0256  heparinase II/III family protein  27.97 
 
 
722 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.627284  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1166  Heparinase II/III family protein  26.15 
 
 
741 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.307073  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2067  Heparinase II/III family protein  26.42 
 
 
744 aa  99.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.720952  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11508  putative chondroitin AC/alginate lyase  24.58 
 
 
759 aa  97.1  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0906796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  20.64 
 
 
651 aa  53.9  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1169  Heparinase II/III family protein  23.28 
 
 
870 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  22.3 
 
 
651 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2409  Heparinase II/III family protein  20.26 
 
 
818 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  26.32 
 
 
702 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  22.71 
 
 
968 aa  49.3  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  26.02 
 
 
702 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  24.17 
 
 
618 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  23.94 
 
 
657 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  26.02 
 
 
702 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  24.41 
 
 
634 aa  45.8  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>