61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4069 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  100 
 
 
545 aa  1131    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  31.11 
 
 
557 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  33.4 
 
 
541 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  31.24 
 
 
547 aa  227  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  32.6 
 
 
561 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  34.44 
 
 
550 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  31.24 
 
 
528 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  35.29 
 
 
587 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  31.87 
 
 
680 aa  176  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  26.92 
 
 
651 aa  150  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  27.97 
 
 
651 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  26.28 
 
 
600 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  25.56 
 
 
603 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  27.26 
 
 
594 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  27.22 
 
 
617 aa  98.2  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  28.29 
 
 
518 aa  77  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  24.71 
 
 
570 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  24.9 
 
 
570 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  24.31 
 
 
570 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  24.86 
 
 
627 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  21.2 
 
 
630 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  22.45 
 
 
668 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  23.42 
 
 
627 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  28.43 
 
 
584 aa  65.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  24.03 
 
 
524 aa  63.9  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  34.25 
 
 
766 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  27.46 
 
 
584 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  24.12 
 
 
657 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  24.35 
 
 
573 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  25.62 
 
 
573 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  24.36 
 
 
568 aa  61.6  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  23.67 
 
 
629 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  24.55 
 
 
702 aa  57.4  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  23.98 
 
 
628 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  28.34 
 
 
584 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0124  Heparinase II/III family protein  21.84 
 
 
594 aa  56.2  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  22.48 
 
 
670 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3705  hypothetical protein  24.45 
 
 
557 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.483181  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  24.05 
 
 
702 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  30.77 
 
 
702 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  22.11 
 
 
906 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  23.68 
 
 
617 aa  51.2  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  24 
 
 
580 aa  50.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  23.66 
 
 
569 aa  50.4  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  23.23 
 
 
610 aa  50.4  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  25.37 
 
 
584 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  28.36 
 
 
584 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  22.77 
 
 
548 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  30.63 
 
 
568 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  20.96 
 
 
560 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  23.74 
 
 
543 aa  49.3  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  23.93 
 
 
571 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  24.77 
 
 
592 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  24.59 
 
 
581 aa  47.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  23.75 
 
 
614 aa  47.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  23.74 
 
 
582 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3077  hypothetical protein  24.89 
 
 
712 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  21.84 
 
 
548 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  49.02 
 
 
1260 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  22.34 
 
 
1188 aa  44.3  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  44.44 
 
 
968 aa  43.9  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>