59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3884 on replicon NC_010578
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  100 
 
 		 617 aa  1245    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  38.17 
 
 		 594 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  36.68 
 
 		 557 aa  126  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  31.99 
 
 		 547 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  31.99 
 
 		 550 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  34.04 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  25.83 
 
 		 541 aa  115  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  28.96 
 
 		 680 aa  107  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  31.71 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  25.6 
 
 		 651 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  32.83 
 
 		 587 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  27.03 
 
 		 651 aa  97.8  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  26.5 
 
 		 545 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  26.98 
 
 		 603 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  26.51 
 
 		 592 aa  74.3  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  29.36 
 
 		 571 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  26.94 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  24.72 
 
 		 629 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  27.01 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  27.14 
 
 		 584 aa  67.4  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  28.15 
 
 		 584 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  28.04 
 
 		 628 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  28.73 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  28.04 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  31.49 
 
 		 597 aa  61.6  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  26.24 
 
 		 568 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  32.34 
 
 		 569 aa  59.7  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  26.17 
 
 		 581 aa  59.3  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  32.45 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  29.89 
 
 		 570 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  25.09 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  37.66 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  37.36 
 
 		 766 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  25.09 
 
 		 548 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  29.35 
 
 		 570 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  29.35 
 
 		 570 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  22.16 
 
 		 600 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  24.72 
 
 		 569 aa  53.9  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  37.84 
 
 		 627 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  29.24 
 
 		 614 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  43.02 
 
 		 702 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  43.02 
 
 		 702 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  43.02 
 
 		 702 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  30 
 
 		 617 aa  51.6  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  33.08 
 
 		 580 aa  51.6  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  29.85 
 
 		 573 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  30.72 
 
 		 543 aa  51.2  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  30.1 
 
 		 668 aa  50.8  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  26.37 
 
 		 573 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  31.58 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  24.52 
 
 		 634 aa  49.3  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  19.87 
 
 		 630 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  26.95 
 
 		 592 aa  47.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  24.82 
 
 		 610 aa  47.8  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0680  heparinase II/III-like  27.59 
 
 		 738 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  27.07 
 
 		 670 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  25.82 
 
 		 584 aa  44.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3705  hypothetical protein  26.5 
 
 		 557 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.483181  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  28.42 
 
 		 628 aa  43.5  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>