55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4241 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  96.53 
 
 
548 aa  1028    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  100 
 
 
548 aa  1112    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  58.55 
 
 
568 aa  611  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  57.25 
 
 
518 aa  596  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  46.01 
 
 
568 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  47.39 
 
 
580 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  45.95 
 
 
617 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  46.55 
 
 
543 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  41.25 
 
 
584 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  40.57 
 
 
628 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  40.38 
 
 
584 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  40.45 
 
 
592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  39.24 
 
 
584 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  39.47 
 
 
571 aa  353  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  38.84 
 
 
614 aa  353  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  37.07 
 
 
569 aa  349  9e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  40.57 
 
 
584 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  42.83 
 
 
581 aa  342  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  39.88 
 
 
569 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  38.85 
 
 
573 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  39.48 
 
 
573 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  38.9 
 
 
570 aa  322  8e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  38.71 
 
 
570 aa  321  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  38.33 
 
 
570 aa  316  7e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  38.86 
 
 
582 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  35.66 
 
 
629 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  34.6 
 
 
610 aa  263  8e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  32.62 
 
 
524 aa  236  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  31.96 
 
 
597 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  30.64 
 
 
584 aa  210  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  30 
 
 
592 aa  193  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  27.57 
 
 
581 aa  183  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  29.66 
 
 
628 aa  174  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  28.08 
 
 
575 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  29.24 
 
 
572 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  28.03 
 
 
565 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2719  heparinase II/III family protein  29.88 
 
 
549 aa  153  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451444  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  27.88 
 
 
567 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  27.88 
 
 
567 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4781  heparinase II/III family protein  28.12 
 
 
596 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  25.68 
 
 
557 aa  103  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  24.12 
 
 
541 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  25.78 
 
 
547 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  26.74 
 
 
587 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  26.48 
 
 
550 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  25.48 
 
 
561 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  23.97 
 
 
603 aa  72.4  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  29.82 
 
 
594 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  24.33 
 
 
680 aa  60.5  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  20.05 
 
 
651 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  28.8 
 
 
617 aa  56.6  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  25.25 
 
 
528 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  22.99 
 
 
545 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  19 
 
 
651 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  23.7 
 
 
600 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>