50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4041 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  100 
 
 
584 aa  1168    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  48.57 
 
 
581 aa  506  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  45.09 
 
 
572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  40.22 
 
 
565 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  42.02 
 
 
567 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  42.57 
 
 
567 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2719  heparinase II/III family protein  38.71 
 
 
549 aa  298  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451444  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  31.69 
 
 
584 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  32.89 
 
 
614 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  32.98 
 
 
629 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  30.14 
 
 
628 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  31.26 
 
 
592 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  30.55 
 
 
584 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  31.19 
 
 
584 aa  217  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  34 
 
 
580 aa  217  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  33.86 
 
 
543 aa  216  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  33.8 
 
 
617 aa  216  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  32.38 
 
 
568 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  31.1 
 
 
571 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  29.85 
 
 
584 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  33.39 
 
 
524 aa  199  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  31.63 
 
 
610 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  30.38 
 
 
548 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  30.06 
 
 
568 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  30.38 
 
 
548 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  28.9 
 
 
569 aa  187  5e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  31.95 
 
 
570 aa  186  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  31.95 
 
 
570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  30.86 
 
 
569 aa  183  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  31.54 
 
 
570 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  31.14 
 
 
575 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  29.66 
 
 
518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  28.15 
 
 
592 aa  174  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  32.5 
 
 
582 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  31.02 
 
 
573 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  30.62 
 
 
597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  31.02 
 
 
573 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  30.06 
 
 
581 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  27.57 
 
 
628 aa  160  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4781  heparinase II/III family protein  31.28 
 
 
596 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  23.46 
 
 
541 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  25.91 
 
 
557 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  23.56 
 
 
547 aa  66.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  24.41 
 
 
587 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  23.52 
 
 
561 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  25.06 
 
 
550 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  28.36 
 
 
545 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  23.08 
 
 
627 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  26.67 
 
 
594 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  25.82 
 
 
617 aa  44.3  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>