48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2927 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  83.88 
 
 
567 aa  830    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  83.42 
 
 
567 aa  842    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  100 
 
 
565 aa  1081    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  45.84 
 
 
581 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  46.25 
 
 
572 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  40.22 
 
 
584 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2719  heparinase II/III family protein  41.12 
 
 
549 aa  298  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451444  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  33.08 
 
 
571 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  32.01 
 
 
629 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  30.74 
 
 
592 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  33.4 
 
 
524 aa  176  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  31.85 
 
 
614 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  31.42 
 
 
584 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  29.65 
 
 
568 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  29.19 
 
 
628 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  32.17 
 
 
610 aa  166  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  31.15 
 
 
584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  30.39 
 
 
581 aa  161  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  28.85 
 
 
584 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  29.12 
 
 
584 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  29.98 
 
 
575 aa  156  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  29.69 
 
 
569 aa  156  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  31.08 
 
 
597 aa  150  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  30.62 
 
 
570 aa  147  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  30.49 
 
 
570 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  30.33 
 
 
617 aa  147  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  30.33 
 
 
543 aa  146  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  28.29 
 
 
548 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  30.43 
 
 
570 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  28.11 
 
 
548 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  30.33 
 
 
580 aa  145  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  31.62 
 
 
628 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  31.48 
 
 
592 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  32.26 
 
 
573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  28.67 
 
 
518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  25.32 
 
 
569 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  29.43 
 
 
582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  31.51 
 
 
573 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  25 
 
 
568 aa  110  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4781  heparinase II/III family protein  29.64 
 
 
596 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  25.58 
 
 
557 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  23.96 
 
 
547 aa  69.3  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  25.33 
 
 
561 aa  60.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  23.41 
 
 
550 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  21.02 
 
 
541 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  24.86 
 
 
587 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  31.25 
 
 
617 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  24.86 
 
 
528 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>