47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3127 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  100 
 
 		 592 aa  1172    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  53.29 
 
 		 575 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  47.64 
 
 		 628 aa  485  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  34.01 
 
 		 629 aa  256  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  33.65 
 
 		 524 aa  234  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  32.31 
 
 		 614 aa  212  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  30.89 
 
 		 571 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  30.21 
 
 		 584 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  30.58 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  31.3 
 
 		 597 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  30.56 
 
 		 584 aa  196  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  30.31 
 
 		 581 aa  196  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  29.9 
 
 		 584 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  30.98 
 
 		 568 aa  194  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  30.64 
 
 		 518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  31.1 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  30.73 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  30 
 
 		 548 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  30.43 
 
 		 570 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  30.22 
 
 		 580 aa  186  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  29.52 
 
 		 568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  29.85 
 
 		 543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  30.24 
 
 		 570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  30.24 
 
 		 570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  29.85 
 
 		 617 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  29.7 
 
 		 584 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  30.02 
 
 		 548 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  28.02 
 
 		 628 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  28.15 
 
 		 584 aa  178  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  32.35 
 
 		 573 aa  178  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  29.75 
 
 		 581 aa  177  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  30.92 
 
 		 573 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  29.93 
 
 		 572 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  26.48 
 
 		 569 aa  170  7e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  30.98 
 
 		 582 aa  170  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4781  heparinase II/III family protein  29.91 
 
 		 596 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  30.37 
 
 		 565 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  28.95 
 
 		 567 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  29.81 
 
 		 567 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2719  heparinase II/III family protein  28.91 
 
 		 549 aa  133  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451444  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  24.58 
 
 		 557 aa  65.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  23.16 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  25.35 
 
 		 550 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  21.99 
 
 		 541 aa  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  26.95 
 
 		 617 aa  47.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  25 
 
 		 561 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  26.49 
 
 		 594 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>