52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0625 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  100 
 
 		 597 aa  1193    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  51.47 
 
 		 524 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  35.64 
 
 		 592 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  36.14 
 
 		 584 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  34.94 
 
 		 584 aa  252  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  34.33 
 
 		 629 aa  243  9e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  33.73 
 
 		 628 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  33.76 
 
 		 571 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  34.39 
 
 		 584 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  33.53 
 
 		 584 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  34.77 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  34.24 
 
 		 570 aa  208  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  30.6 
 
 		 610 aa  207  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  31.9 
 
 		 568 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  33.04 
 
 		 568 aa  205  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  32.35 
 
 		 548 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  33.4 
 
 		 570 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  31.96 
 
 		 548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  33.2 
 
 		 570 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  33.55 
 
 		 580 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  33.19 
 
 		 543 aa  195  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  32.98 
 
 		 617 aa  194  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  31.24 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  34.29 
 
 		 569 aa  191  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  31.1 
 
 		 592 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  33.9 
 
 		 581 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  33.03 
 
 		 573 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  32.14 
 
 		 573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  29.03 
 
 		 569 aa  177  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  31.87 
 
 		 581 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  31.35 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  31.94 
 
 		 628 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  30.62 
 
 		 584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  30.24 
 
 		 575 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  30.08 
 
 		 572 aa  160  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  31.04 
 
 		 565 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  30.63 
 
 		 567 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  30.04 
 
 		 567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2719  heparinase II/III family protein  30.92 
 
 		 549 aa  126  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451444  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4781  heparinase II/III family protein  26.72 
 
 		 596 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  29.25 
 
 		 557 aa  94  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  25.14 
 
 		 547 aa  89.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  24.56 
 
 		 561 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  27.07 
 
 		 587 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  25 
 
 		 541 aa  73.9  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  29.62 
 
 		 680 aa  71.2  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  34.65 
 
 		 594 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  26.46 
 
 		 550 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  31.49 
 
 		 617 aa  62  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  24.1 
 
 		 603 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  24.39 
 
 		 528 aa  44.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  21.58 
 
 		 600 aa  43.9  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>