48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1101 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  98.94 
 
 		 567 aa  1073    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  100 
 
 		 567 aa  1083    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  83.78 
 
 		 565 aa  869    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  44.84 
 
 		 581 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  47.46 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  42.2 
 
 		 584 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2719  heparinase II/III family protein  39.34 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451444  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  31.82 
 
 		 629 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  32.63 
 
 		 614 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  30.58 
 
 		 592 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  31.91 
 
 		 571 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  30.11 
 
 		 568 aa  178  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  33.26 
 
 		 524 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  28.95 
 
 		 628 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  28.44 
 
 		 584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  30.77 
 
 		 584 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  31 
 
 		 575 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  30.78 
 
 		 584 aa  162  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  31.39 
 
 		 610 aa  161  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  30.71 
 
 		 581 aa  160  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  28.71 
 
 		 584 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  29.69 
 
 		 569 aa  157  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  31.52 
 
 		 597 aa  154  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  30.2 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  30.2 
 
 		 617 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  30.57 
 
 		 580 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  31.62 
 
 		 592 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  28.21 
 
 		 548 aa  144  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  28.02 
 
 		 548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  29 
 
 		 570 aa  140  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  29.19 
 
 		 570 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  28.06 
 
 		 569 aa  139  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  29 
 
 		 570 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  31.28 
 
 		 628 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  29.06 
 
 		 518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  30.75 
 
 		 573 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  30.51 
 
 		 582 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  31 
 
 		 573 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  26.16 
 
 		 568 aa  120  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4781  heparinase II/III family protein  29.32 
 
 		 596 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  23.68 
 
 		 547 aa  76.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  24.93 
 
 		 557 aa  68.2  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  21.6 
 
 		 541 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  24.72 
 
 		 561 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  22.39 
 
 		 550 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  25.1 
 
 		 545 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  25.68 
 
 		 528 aa  50.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  26.01 
 
 		 587 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>