44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4781 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4781  heparinase II/III family protein  100 
 
 
596 aa  1173    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  34.78 
 
 
610 aa  263  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  33.76 
 
 
629 aa  220  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  30.09 
 
 
584 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  30.64 
 
 
628 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  29.89 
 
 
584 aa  189  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  32.85 
 
 
518 aa  187  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  30.78 
 
 
614 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  29.32 
 
 
584 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  29.21 
 
 
571 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  31.12 
 
 
524 aa  176  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  28.65 
 
 
592 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  31 
 
 
573 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  30.32 
 
 
568 aa  173  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  29.03 
 
 
570 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  30.1 
 
 
573 aa  169  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  31.28 
 
 
584 aa  167  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  28.86 
 
 
570 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  32.07 
 
 
569 aa  166  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  30.08 
 
 
584 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  28.6 
 
 
570 aa  157  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  26.65 
 
 
569 aa  156  9e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  29.62 
 
 
581 aa  153  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  29.91 
 
 
592 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  30.2 
 
 
575 aa  143  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  28.75 
 
 
581 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  29.39 
 
 
582 aa  138  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  28.15 
 
 
548 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  30.72 
 
 
617 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  30.92 
 
 
543 aa  137  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  31.33 
 
 
580 aa  136  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  28.28 
 
 
548 aa  134  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  28.39 
 
 
568 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  29.07 
 
 
628 aa  118  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  29.61 
 
 
572 aa  113  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  29.78 
 
 
565 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  26.72 
 
 
597 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  29.39 
 
 
567 aa  94.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  29.57 
 
 
567 aa  93.6  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2719  heparinase II/III family protein  26.96 
 
 
549 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451444  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  25.18 
 
 
547 aa  47  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  24.77 
 
 
587 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  27.5 
 
 
557 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  26.53 
 
 
594 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>