48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3032 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  100 
 
 		 572 aa  1122    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  47.9 
 
 		 581 aa  492  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  45.92 
 
 		 584 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  46.17 
 
 		 565 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  47.64 
 
 		 567 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  47.46 
 
 		 567 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2719  heparinase II/III family protein  41.38 
 
 		 549 aa  311  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451444  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  33.33 
 
 		 614 aa  206  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  29.83 
 
 		 592 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  29.1 
 
 		 628 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  31.61 
 
 		 571 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  30 
 
 		 584 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  30.09 
 
 		 568 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  28.92 
 
 		 584 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  32.14 
 
 		 629 aa  189  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  29.48 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  29.32 
 
 		 584 aa  188  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  31.26 
 
 		 581 aa  180  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  30.34 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  30.34 
 
 		 617 aa  177  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  29.96 
 
 		 580 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  31.49 
 
 		 610 aa  173  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  31.37 
 
 		 575 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  29.93 
 
 		 592 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  29.17 
 
 		 569 aa  166  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  27.95 
 
 		 569 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  30.08 
 
 		 597 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  31.63 
 
 		 570 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  29.58 
 
 		 524 aa  160  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  28.06 
 
 		 568 aa  160  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  29.61 
 
 		 548 aa  160  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  29.24 
 
 		 548 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  30.92 
 
 		 570 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  30.92 
 
 		 570 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  29.98 
 
 		 628 aa  157  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  31.02 
 
 		 573 aa  156  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  28.04 
 
 		 518 aa  154  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  30.58 
 
 		 582 aa  153  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  30.29 
 
 		 573 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4781  heparinase II/III family protein  29.61 
 
 		 596 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  27.33 
 
 		 557 aa  98.2  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  23.87 
 
 		 547 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  22.78 
 
 		 541 aa  67  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  26.02 
 
 		 550 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  23.16 
 
 		 561 aa  54.7  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  24.44 
 
 		 587 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  25.49 
 
 		 680 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  25.93 
 
 		 627 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>