38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0471 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  100 
 
 
630 aa  1246    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  24.8 
 
 
702 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  24.8 
 
 
702 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  23.58 
 
 
702 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  24.16 
 
 
627 aa  183  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  23.77 
 
 
668 aa  181  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  25.38 
 
 
675 aa  147  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  29.28 
 
 
766 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  26.02 
 
 
627 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  24.01 
 
 
630 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  27.79 
 
 
651 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1124  Heparinase II/III family protein  20.23 
 
 
616 aa  103  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  25.14 
 
 
651 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02344  hypothetical protein  21.58 
 
 
612 aa  98.6  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  23.75 
 
 
657 aa  94.7  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  23.14 
 
 
561 aa  94.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  22.14 
 
 
603 aa  89.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  23.12 
 
 
541 aa  87  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  20.29 
 
 
557 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  20.53 
 
 
587 aa  74.3  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  20.94 
 
 
670 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  20.41 
 
 
545 aa  70.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  19.58 
 
 
680 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  20.74 
 
 
547 aa  68.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  20.21 
 
 
550 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1969  hypothetical protein  22.53 
 
 
760 aa  63.9  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  25.35 
 
 
672 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  25.13 
 
 
672 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  21.49 
 
 
528 aa  57.4  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  21.51 
 
 
634 aa  50.8  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  27.06 
 
 
594 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  22.15 
 
 
968 aa  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  22.77 
 
 
600 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0124  Heparinase II/III family protein  23.24 
 
 
594 aa  48.5  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  33.8 
 
 
617 aa  48.1  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0680  heparinase II/III-like  22.61 
 
 
738 aa  47.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  20.72 
 
 
906 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  19.47 
 
 
1260 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>