18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0680 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0680  heparinase II/III-like  100 
 
 
738 aa  1495    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  20.7 
 
 
906 aa  87.4  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  24.23 
 
 
896 aa  87  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  24.23 
 
 
908 aa  87  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  24.23 
 
 
896 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  24.66 
 
 
560 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1388  hypothetical protein  25.37 
 
 
609 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.210626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2808  hypothetical protein  25.97 
 
 
504 aa  63.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0791848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3705  hypothetical protein  24.44 
 
 
557 aa  60.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.483181  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  26.85 
 
 
630 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  33.56 
 
 
702 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  33.56 
 
 
702 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  33.58 
 
 
702 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  24.83 
 
 
627 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  22.09 
 
 
670 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  22.61 
 
 
630 aa  47.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  23.91 
 
 
603 aa  47.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3077  hypothetical protein  26.09 
 
 
712 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>