42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1891 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  100 
 
 
968 aa  1969    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  29.73 
 
 
670 aa  72.8  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  26.85 
 
 
657 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  25.45 
 
 
627 aa  64.7  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3077  hypothetical protein  26.44 
 
 
712 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  25.95 
 
 
672 aa  64.3  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  25.94 
 
 
672 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  30.46 
 
 
908 aa  59.7  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  30.46 
 
 
896 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  30.46 
 
 
896 aa  59.7  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3651  heparinase II/III-like  23.93 
 
 
748 aa  56.6  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324454  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  31.68 
 
 
1260 aa  56.6  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  24.62 
 
 
630 aa  55.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1166  Heparinase II/III family protein  30.43 
 
 
741 aa  54.7  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.307073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  28.65 
 
 
906 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11508  putative chondroitin AC/alginate lyase  30.61 
 
 
759 aa  52.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0906796  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  26.45 
 
 
557 aa  52.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  23.15 
 
 
634 aa  52  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  32.46 
 
 
668 aa  51.2  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  27.82 
 
 
627 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1169  Heparinase II/III family protein  24.3 
 
 
870 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  22.15 
 
 
630 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  22.71 
 
 
672 aa  48.9  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  22.71 
 
 
672 aa  48.9  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  22.71 
 
 
672 aa  49.3  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  30.07 
 
 
561 aa  49.3  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  23.53 
 
 
1188 aa  48.9  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3705  hypothetical protein  28.97 
 
 
557 aa  48.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.483181  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  35.96 
 
 
528 aa  47.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2067  Heparinase II/III family protein  26.35 
 
 
744 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.720952  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0251  heparinase II/III-like  24.62 
 
 
772 aa  46.2  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.884612  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46500  alginate lyase  24.03 
 
 
742 aa  45.8  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481088  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  24.92 
 
 
603 aa  45.8  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  27.2 
 
 
680 aa  45.8  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0489  heparinase II/III family protein  38.6 
 
 
622 aa  45.8  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  27.69 
 
 
560 aa  45.8  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0488  heparinase II/III family protein  22.83 
 
 
761 aa  45.8  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0256  heparinase II/III family protein  31.82 
 
 
722 aa  45.4  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.627284  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3284  hypothetical protein  27.21 
 
 
736 aa  45.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.924939  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3104  heparinase II/III family protein  24.47 
 
 
760 aa  44.7  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220096  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  27.53 
 
 
600 aa  44.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  25.11 
 
 
550 aa  44.3  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>