13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2808 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2808  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  1017    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0791848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  66.82 
 
 
560 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3705  hypothetical protein  53.57 
 
 
557 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.483181  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0680  heparinase II/III-like  25.97 
 
 
738 aa  63.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  26.32 
 
 
908 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  26.32 
 
 
896 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  26.32 
 
 
896 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  22.05 
 
 
906 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1543  hypothetical protein  28.34 
 
 
1108 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  27.78 
 
 
670 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0595  hypothetical protein  29.85 
 
 
888 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.395193 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  30.86 
 
 
1188 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1388  hypothetical protein  25.49 
 
 
609 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.210626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>