More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0266 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  100 
 
 
779 aa  1523    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  50.32 
 
 
772 aa  684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  53.74 
 
 
784 aa  684    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  50.32 
 
 
772 aa  684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  50.19 
 
 
772 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  48.86 
 
 
787 aa  595  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  46.17 
 
 
755 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  45.14 
 
 
734 aa  552  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  44.95 
 
 
728 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  45.1 
 
 
735 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  45.42 
 
 
791 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  43.28 
 
 
779 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  42.75 
 
 
854 aa  542  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  45.37 
 
 
832 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  45.57 
 
 
731 aa  537  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  46.39 
 
 
724 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  44.88 
 
 
735 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  43.45 
 
 
737 aa  523  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  43.85 
 
 
723 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  42.99 
 
 
840 aa  515  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  42.4 
 
 
843 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  40.89 
 
 
732 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  42.86 
 
 
793 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  48.28 
 
 
1092 aa  467  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  42.7 
 
 
734 aa  469  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  40.58 
 
 
787 aa  468  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  38.5 
 
 
920 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  42.78 
 
 
729 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  35.38 
 
 
829 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  39.21 
 
 
958 aa  455  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  35.38 
 
 
829 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  42.89 
 
 
734 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.25 
 
 
1382 aa  448  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  38.19 
 
 
742 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  45.84 
 
 
726 aa  446  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  38.62 
 
 
917 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  39.69 
 
 
909 aa  439  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  41.18 
 
 
1002 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  34.65 
 
 
893 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  41.06 
 
 
1058 aa  428  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  35.83 
 
 
743 aa  405  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.76 
 
 
746 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  42.73 
 
 
738 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  41.45 
 
 
732 aa  402  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  34.57 
 
 
704 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  38.56 
 
 
807 aa  396  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  39.38 
 
 
903 aa  386  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  35.94 
 
 
735 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  33.46 
 
 
760 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  39.43 
 
 
737 aa  366  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  34.06 
 
 
842 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  39.87 
 
 
903 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  42.1 
 
 
726 aa  357  6.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  35.28 
 
 
752 aa  355  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  35.64 
 
 
717 aa  351  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.51 
 
 
729 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  32.67 
 
 
876 aa  347  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  34.21 
 
 
751 aa  343  7e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.96 
 
 
758 aa  343  8e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  35.87 
 
 
732 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  34.12 
 
 
737 aa  340  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  35.35 
 
 
718 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.64 
 
 
735 aa  327  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  35.23 
 
 
726 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.83 
 
 
740 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.17 
 
 
715 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  32.67 
 
 
711 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  35.51 
 
 
749 aa  301  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  31.72 
 
 
781 aa  291  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  36.03 
 
 
714 aa  290  9e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  38.84 
 
 
761 aa  289  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  31.5 
 
 
750 aa  287  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  32.37 
 
 
723 aa  286  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  34.15 
 
 
724 aa  278  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  35.29 
 
 
743 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.9 
 
 
983 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.9 
 
 
983 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.72 
 
 
979 aa  247  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.39 
 
 
968 aa  243  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  34.62 
 
 
978 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.19 
 
 
758 aa  238  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  28.77 
 
 
966 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  32.5 
 
 
757 aa  218  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  28.26 
 
 
740 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.76 
 
 
738 aa  211  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 
846 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  28.9 
 
 
794 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  33.16 
 
 
743 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.39 
 
 
741 aa  201  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  27.7 
 
 
997 aa  200  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.85 
 
 
730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.27 
 
 
1095 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  31.71 
 
 
737 aa  198  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  27.93 
 
 
736 aa  198  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  29.89 
 
 
736 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  31.11 
 
 
761 aa  197  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.24 
 
 
730 aa  196  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  24.31 
 
 
1013 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  28.44 
 
 
743 aa  196  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.49 
 
 
730 aa  195  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>