More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4929 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  86.14 
 
 		 441 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  81.41 
 
 		 460 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  84.93 
 
 		 437 aa  743    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  94.82 
 
 		 469 aa  823    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  84.93 
 
 		 437 aa  743    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 471 aa  941    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  85.39 
 
 		 437 aa  736    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  69.09 
 
 		 445 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  68.64 
 
 		 445 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  62.56 
 
 		 440 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  62.44 
 
 		 436 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  59.45 
 
 		 437 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  57.77 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  57.14 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  57.61 
 
 		 464 aa  455  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  59.5 
 
 		 440 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  56.6 
 
 		 446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  51.97 
 
 		 439 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  55.61 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  52.11 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  51.79 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  51.46 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  57.98 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  50.67 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  50.67 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  55.66 
 
 		 439 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  55.2 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  51.24 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  50.8 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  50.45 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  50.56 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  55.2 
 
 		 473 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  53.23 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  55.66 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  45.89 
 
 		 475 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  46.86 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  49.4 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  50.25 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  54.15 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  46.54 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  44.74 
 
 		 490 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  49.75 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  45.23 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  46.68 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  48.11 
 
 		 421 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  39.37 
 
 		 484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  37.53 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  28.57 
 
 		 1041 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  37.13 
 
 		 416 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  32.86 
 
 		 1263 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.41 
 
 		 863 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32 
 
 		 937 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32 
 
 		 937 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  29.29 
 
 		 482 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.02 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.53 
 
 		 1015 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.46 
 
 		 892 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.11 
 
 		 1107 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  30.32 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.5 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  29.61 
 
 		 757 aa  73.6  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  28.57 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.47 
 
 		 886 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.56 
 
 		 867 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  27.89 
 
 		 713 aa  70.9  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  37.84 
 
 		 761 aa  70.5  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  34.72 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  29.94 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.96 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.05 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 		 627 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 612 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38832  predicted protein  29.07 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00223865  hitchhiker  0.00603177 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  28.48 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  24.7 
 
 		 925 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  28.57 
 
 		 1017 aa  60.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  31.34 
 
 		 1024 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  26.59 
 
 		 1749 aa  60.5  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  31.54 
 
 		 648 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51279  predicted protein  28.77 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  30.58 
 
 		 980 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  20.56 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.25 
 
 		 972 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  31.14 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  26.99 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 		 721 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.9 
 
 		 650 aa  57.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57744  predicted protein  23.5 
 
 		 893 aa  57.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01750  Cdc2 cyclin-dependent kinase, putative  23.39 
 
 		 298 aa  57  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.588501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  29.91 
 
 		 963 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 612 aa  57  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  28.84 
 
 		 559 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  34.48 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20262  predicted protein  23.74 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  31.58 
 
 		 615 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.78 
 
 		 627 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04290  protein kinase, putative  27.96 
 
 		 573 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0054946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  26.51 
 
 		 791 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21961  predicted protein  26.6 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>