139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3011 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I3011  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 184 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  88.52 
 
 		 186 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  88.52 
 
 		 186 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3219  hypothetical protein  88.52 
 
 		 186 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1770  hypothetical protein  88.52 
 
 		 186 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3686  2'-5' RNA ligase  88.52 
 
 		 186 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  88.52 
 
 		 186 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  87.98 
 
 		 186 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0326  2'-5' RNA ligase  53.98 
 
 		 182 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0308  2'-5' RNA ligase  56.59 
 
 		 191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0335  2'-5' RNA ligase  54.55 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19642 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3503  2',5' RNA ligase  52.2 
 
 		 192 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.968383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2702  2',5' RNA ligase  52.2 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0405  2'-5' RNA ligase  52.2 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0384  2'-5' RNA ligase  52.2 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2786  2'-5' RNA ligase  47.19 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  32.94 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  33.91 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  31.69 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  32.39 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  32.22 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  26.01 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  30.46 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  32.35 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  30.39 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  30.51 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  27.33 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  29.61 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  25.53 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  31.18 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  29.89 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  29.45 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  31.35 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  32.97 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  25.55 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  23.26 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  30.46 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  23.85 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  31.64 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  22.94 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  26.98 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  26.67 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  29.92 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  31.87 
 
 		 174 aa  51.2  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  25 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  25.37 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  23.83 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  33.96 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  25.19 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  23.08 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  27.57 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  31.61 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  21.58 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5153  2'-5' RNA ligase  30.34 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198908  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  27.34 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  22.52 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  25.35 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  28.5 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  23.86 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2498  2'-5' RNA ligase  21.51 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  18.89 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0184  2',5' RNA ligase  26.67 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  27.6 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  37.4 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  26.97 
 
 		 176 aa  48.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  24.63 
 
 		 184 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  29.44 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  25.87 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  32.11 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  21.58 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  21.05 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  29.03 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  33.01 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3896  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0415456  normal  0.638884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  29.3 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  20.81 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  22.73 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  27.92 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  30.19 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  30.73 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  22.16 
 
 		 189 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  27.53 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  26.47 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27110  2'-5' RNA ligase  34.97 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  29.01 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1728  2'-5' RNA ligase  27.41 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.747406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>