More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2369 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  100 
 
 		 368 aa  768    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 285 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 294 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  34.56 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 		 202 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 295 aa  86.3  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  40.2 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  34.35 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 291 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 157 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 290 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  40.4 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  41.84 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 		 291 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 311 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 311 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 289 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  40.22 
 
 		 168 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 182 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  40.22 
 
 		 168 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  33.06 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4441  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.440571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  35.79 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  28.07 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  34.31 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2022  AraC family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00965402  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  29.33 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  40.22 
 
 		 164 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  41.76 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4555  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  34.62 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>