More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2022 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2022  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00965402  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  23.08 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  28.41 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  34.46 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  26.7 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  27.32 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  26.39 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  25.33 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0193  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  26.87 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  23.59 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  26.92 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  25.23 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  38.95 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  39.02 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  23.7 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  25.54 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  37.11 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  37.89 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2162  transcriptional regulator, AraC family  36.13 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.637504 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  38.24 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0648  helix-turn-helix domain-containing protein  35.19 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.369087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  22.84 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  24.76 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3074  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.618991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4504  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.991851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  25.23 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0064  helix-turn-helix, AraC type  27.88 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.585972  normal  0.173321 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  29.49 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 168 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  28.39 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 136 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4209  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  24.87 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4732  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583037  normal  0.778769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>