66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0063 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  60.17 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  55.81 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  57.06 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  47.8 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  52.94 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  53.01 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  54.66 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  54.97 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  54.97 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  51.69 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  52.05 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  52.76 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  52.76 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  52.76 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  50.88 
 
 		 267 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  51.79 
 
 		 267 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  42.92 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  50.32 
 
 		 169 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  37.08 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  42.77 
 
 		 177 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  39.22 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  39.47 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  39.74 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  42.66 
 
 		 225 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  40.54 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  40.79 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  34.62 
 
 		 203 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0035  pilx1 protein  33.33 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  39.63 
 
 		 224 aa  95.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  43.64 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  42.62 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  34.69 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  41.53 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  35.03 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  41.82 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  37.75 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  42.99 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  33.33 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  33.33 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  32.1 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  34.44 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  30.22 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0258  Type IV secretory pathway AvhB1 protein  32.28 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  30.43 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  29.03 
 
 		 306 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  31.3 
 
 		 306 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  29.06 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  29.57 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  29.57 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  31.4 
 
 		 166 aa  46.2  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  27.7 
 
 		 279 aa  45.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  27.7 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  23.71 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  36.76 
 
 		 140 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  24.56 
 
 		 168 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  28.26 
 
 		 179 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6789  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 165 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>