89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_2019 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  44.86 
 
 
1064 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  44.36 
 
 
1062 aa  784    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  99.81 
 
 
1052 aa  2081    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  56.26 
 
 
1042 aa  1033    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  86.84 
 
 
1052 aa  1792    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  50.24 
 
 
1047 aa  986    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  45.24 
 
 
1059 aa  845    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  45.01 
 
 
1064 aa  794    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 
1052 aa  2085    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  39.4 
 
 
1049 aa  595  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  39.89 
 
 
1048 aa  591  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  39.27 
 
 
1049 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  40.15 
 
 
1001 aa  592  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  39.76 
 
 
1047 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  39.7 
 
 
1047 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  40.06 
 
 
1045 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  39.98 
 
 
1043 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  39.24 
 
 
1053 aa  572  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  39.46 
 
 
1042 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  41.83 
 
 
1015 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  40.04 
 
 
1048 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  39.45 
 
 
1049 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  39.69 
 
 
1040 aa  551  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  39.96 
 
 
1037 aa  548  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  37.94 
 
 
1054 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  38.69 
 
 
1018 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  35.7 
 
 
1076 aa  496  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  37.42 
 
 
999 aa  488  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  33.08 
 
 
977 aa  418  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  35.25 
 
 
1016 aa  406  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  36.25 
 
 
991 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  34.44 
 
 
1000 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  32.95 
 
 
997 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  33.11 
 
 
997 aa  386  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  35.1 
 
 
1014 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  32.42 
 
 
986 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  31.33 
 
 
988 aa  356  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  33.27 
 
 
991 aa  340  8e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  30.63 
 
 
993 aa  337  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  31.77 
 
 
980 aa  332  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  33.84 
 
 
959 aa  301  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  20.87 
 
 
914 aa  178  6e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  21.19 
 
 
911 aa  173  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  25.46 
 
 
962 aa  94.4  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  23.51 
 
 
890 aa  87  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  24.71 
 
 
947 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  24.91 
 
 
976 aa  76.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  24.4 
 
 
779 aa  76.6  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.12 
 
 
836 aa  73.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.38 
 
 
957 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  34.65 
 
 
864 aa  68.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  23.92 
 
 
951 aa  68.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  23.77 
 
 
781 aa  66.6  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  22.84 
 
 
991 aa  66.6  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.2 
 
 
958 aa  67  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  43.96 
 
 
142 aa  65.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  33.33 
 
 
846 aa  64.7  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  22.22 
 
 
994 aa  61.6  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  19.55 
 
 
803 aa  57.8  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25 
 
 
957 aa  55.8  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  23.39 
 
 
788 aa  55.1  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  23.39 
 
 
788 aa  55.1  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  23.1 
 
 
788 aa  54.3  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  27.05 
 
 
1059 aa  53.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  23.97 
 
 
855 aa  53.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  20.83 
 
 
781 aa  52.8  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  25.62 
 
 
930 aa  52.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.65 
 
 
1048 aa  50.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  22.91 
 
 
919 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  27.87 
 
 
990 aa  48.5  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  29.85 
 
 
351 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  20.58 
 
 
911 aa  48.1  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.22 
 
 
989 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  29.95 
 
 
302 aa  47.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  25 
 
 
856 aa  47.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  31.13 
 
 
323 aa  47.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  30.15 
 
 
280 aa  47.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  34.55 
 
 
912 aa  47  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.43 
 
 
1051 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  25.83 
 
 
913 aa  46.2  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  24.25 
 
 
984 aa  46.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.14 
 
 
906 aa  45.8  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  31.56 
 
 
856 aa  45.4  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  31.56 
 
 
856 aa  45.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.23 
 
 
935 aa  45.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  28.64 
 
 
1144 aa  45.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.65 
 
 
1049 aa  45.1  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  29.76 
 
 
286 aa  45.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  22.32 
 
 
908 aa  44.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>