More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6912 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 475 aa  964    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18628  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.46 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.01 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249155  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.44 
 
 		 470 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856427  normal  0.10181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 		 468 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.41 
 
 		 470 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.15 
 
 		 495 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.98 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5132  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.98 
 
 		 468 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 		 468 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.82 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.98 
 
 		 487 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1014  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.39 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2227  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.45 
 
 		 481 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.237535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.82 
 
 		 468 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 448 aa  280  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.802467  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37 
 
 		 454 aa  276  8e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00717627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1153  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.4 
 
 		 474 aa  263  6.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3326  chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 		 534 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.21 
 
 		 546 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3480  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 		 533 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0820031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3261  chemotaxis sensory transducer  33.11 
 
 		 534 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55750  putative chemotaxis transducer  32.52 
 
 		 538 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4367  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 		 524 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3042  methyl-accepting chemotaxis protein  31.28 
 
 		 527 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4857  methyl-accepting chemotaxis protein  32.08 
 
 		 535 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0467  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.9 
 
 		 693 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.285916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0484  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.53 
 
 		 693 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000150879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6117  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.6 
 
 		 713 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 698 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.57 
 
 		 514 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4961  methyl-accepting chemotaxis protein  31.95 
 
 		 527 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.94 
 
 		 534 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.695651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03575  methyl-accepting chemotaxis protein  30.67 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.38 
 
 		 695 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.56 
 
 		 696 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3399  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.8 
 
 		 526 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.33 
 
 		 505 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 		 583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.7 
 
 		 480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0715397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.26 
 
 		 522 aa  181  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  27.29 
 
 		 696 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0534  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.38 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6911  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 		 584 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.411338 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 		 522 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.02 
 
 		 573 aa  176  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.72 
 
 		 522 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.26 
 
 		 522 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1290  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.26 
 
 		 522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1155  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.21 
 
 		 523 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 		 584 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.24 
 
 		 707 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 523 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.41 
 
 		 583 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.1 
 
 		 598 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.2 
 
 		 584 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1985  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  28.05 
 
 		 715 aa  160  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2475  methyl-accepting chemotaxis protein  28.48 
 
 		 598 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0390427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2241  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.31 
 
 		 598 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.89 
 
 		 511 aa  143  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.62 
 
 		 602 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.75 
 
 		 525 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.603344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 		 578 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.22 
 
 		 578 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00718884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2381  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.22 
 
 		 578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0606  methyl-accepting chemotaxis protein  32.9 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.59 
 
 		 568 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 550 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  32.78 
 
 		 557 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  37.55 
 
 		 691 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 673 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 602 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  30.27 
 
 		 578 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 		 563 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  29.22 
 
 		 480 aa  103  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001512  aerotaxis sensor receptor protein  36.79 
 
 		 516 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.961146  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 731 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.46 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  33.48 
 
 		 545 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.3 
 
 		 568 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 688 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 714 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.9 
 
 		 568 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  34.98 
 
 		 688 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  36.19 
 
 		 577 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  36.89 
 
 		 688 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 		 558 aa  99.8  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  32.49 
 
 		 561 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 540 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 		 587 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 741 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 		 545 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 		 545 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  33.57 
 
 		 562 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  34.44 
 
 		 554 aa  99  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.55 
 
 		 560 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.45 
 
 		 567 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 		 674 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>