More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4817 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0668  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  49.17 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  44.49 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  40.64 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  41.08 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  40.33 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  42.11 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  40.33 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  39.15 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  41.91 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  43.09 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  42.34 
 
 		 625 aa  188  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  42.56 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  41.8 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  39.27 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.37 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  40.4 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.06 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  40.91 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  38.87 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  42.56 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0854  ABC transporter related  40.16 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.690377  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  42.86 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  38.17 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  39.26 
 
 		 251 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  33.74 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6214  ABC transporter related  40.48 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  38.78 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  37.4 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  38.89 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  36.99 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  39.75 
 
 		 484 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 271 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  40.16 
 
 		 505 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  40.17 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  40.33 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  40.33 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0944  ABC transporter related  38.11 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  35.18 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.99 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1047  ABC transporter related  38.62 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  36.25 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  37.96 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  40.08 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  39.68 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  36.29 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.92 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  37.75 
 
 		 253 aa  174  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  39.51 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  36.99 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  36.99 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  36.99 
 
 		 255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  35.37 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  38.02 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  38.71 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  38.49 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  35.37 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  39.84 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  37.05 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  39.13 
 
 		 257 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  37.32 
 
 		 284 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  36.07 
 
 		 249 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  37.35 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  38.52 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  38.55 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  40.41 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  40.32 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  37.35 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  36.18 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  35.8 
 
 		 252 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  40.57 
 
 		 504 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  37.35 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  36.64 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  38.89 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  36.07 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  37.7 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  37.55 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  38.87 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  38.65 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  38.65 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  36.82 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  40.41 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  38.27 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  36.13 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 259 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  36.96 
 
 		 284 aa  168  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  38.21 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  36.58 
 
 		 289 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  36.02 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  40.68 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>