More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0763 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  84.89 
 
 		 505 aa  800    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  100 
 
 		 504 aa  967    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  43.22 
 
 		 484 aa  343  4e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  43.75 
 
 		 823 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  43.33 
 
 		 823 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  43.27 
 
 		 827 aa  296  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  42.34 
 
 		 842 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  40.89 
 
 		 536 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  40.95 
 
 		 852 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  39.75 
 
 		 859 aa  282  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  40.58 
 
 		 840 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  39.5 
 
 		 502 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  37.55 
 
 		 838 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  39.7 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  42.51 
 
 		 822 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  38.19 
 
 		 490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  40.17 
 
 		 501 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  38.05 
 
 		 863 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  39.15 
 
 		 828 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  38.68 
 
 		 840 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  36.84 
 
 		 494 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  37.5 
 
 		 832 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  38 
 
 		 489 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  36.36 
 
 		 840 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  37.22 
 
 		 830 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  36.33 
 
 		 549 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  34.91 
 
 		 573 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3584  ABC transporter related  35.71 
 
 		 873 aa  216  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282341  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  38.02 
 
 		 1302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 247 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  32.06 
 
 		 508 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  27.62 
 
 		 495 aa  190  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  33.4 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  42.34 
 
 		 251 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  31.59 
 
 		 495 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  39.84 
 
 		 250 aa  186  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  32.12 
 
 		 537 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  32.42 
 
 		 541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  44.63 
 
 		 246 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  28.19 
 
 		 503 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  30.38 
 
 		 519 aa  183  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  39.68 
 
 		 245 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  30.66 
 
 		 532 aa  183  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 256 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  30.06 
 
 		 516 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 248 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  43.57 
 
 		 252 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  27.29 
 
 		 495 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  43.55 
 
 		 256 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1873  ABC transporter related  29.46 
 
 		 506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  26.59 
 
 		 510 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  30.16 
 
 		 524 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  30.02 
 
 		 513 aa  180  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  31.43 
 
 		 522 aa  179  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  29.27 
 
 		 506 aa  179  8e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  28.04 
 
 		 496 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  32 
 
 		 544 aa  179  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  30.51 
 
 		 522 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  24.84 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  24.9 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3320  ABC transporter related  45.69 
 
 		 329 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  39.92 
 
 		 248 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  44.4 
 
 		 272 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  30.8 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  40.39 
 
 		 261 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  42.11 
 
 		 250 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6738  ABC transporter related protein  31.55 
 
 		 532 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  44.87 
 
 		 265 aa  178  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  43.09 
 
 		 253 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  31.87 
 
 		 498 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  44.26 
 
 		 249 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 236 aa  177  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  42.37 
 
 		 273 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  42.68 
 
 		 251 aa  177  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  30.83 
 
 		 509 aa  177  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  40.24 
 
 		 249 aa  176  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  42 
 
 		 252 aa  176  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  27.27 
 
 		 513 aa  176  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  40.64 
 
 		 256 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  27.59 
 
 		 509 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  40.64 
 
 		 256 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  31.74 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  31.11 
 
 		 510 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  25.9 
 
 		 500 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  29.69 
 
 		 522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  40.08 
 
 		 251 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  31.94 
 
 		 505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  42.28 
 
 		 251 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  44 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  32.53 
 
 		 508 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  39.68 
 
 		 254 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  39.36 
 
 		 248 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  40.25 
 
 		 254 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  28.86 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 259 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  27.27 
 
 		 513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  26.38 
 
 		 499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  27.27 
 
 		 513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 		 256 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>