More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0705 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  84.89 
 
 		 504 aa  794    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  100 
 
 		 505 aa  977    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  42.95 
 
 		 484 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  41.8 
 
 		 823 aa  300  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  41.6 
 
 		 823 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  39.74 
 
 		 859 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  39.96 
 
 		 536 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  42.32 
 
 		 827 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  39.46 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  41.61 
 
 		 822 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  37.79 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  38.91 
 
 		 502 aa  280  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  38.78 
 
 		 502 aa  279  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  37.96 
 
 		 832 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  39.69 
 
 		 842 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.24 
 
 		 489 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  38.26 
 
 		 828 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  37.21 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  36.08 
 
 		 838 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  38.59 
 
 		 840 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  38.14 
 
 		 852 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  37.88 
 
 		 830 aa  264  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  36.59 
 
 		 863 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  38.17 
 
 		 840 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  34.99 
 
 		 840 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  34.77 
 
 		 573 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  35.63 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  37.57 
 
 		 1302 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0382  ABC transporter related  34.73 
 
 		 538 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3584  ABC transporter related  35.36 
 
 		 873 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282341  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  27.88 
 
 		 495 aa  196  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  33.72 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  45.26 
 
 		 248 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  28.28 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  32.52 
 
 		 495 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  26.86 
 
 		 510 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  40.5 
 
 		 250 aa  190  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  28.83 
 
 		 496 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  30.11 
 
 		 513 aa  190  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  31.22 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  43.5 
 
 		 253 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  44.21 
 
 		 246 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  46.25 
 
 		 247 aa  187  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  31.4 
 
 		 508 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  40.24 
 
 		 259 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  43.08 
 
 		 256 aa  186  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  26.45 
 
 		 500 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.29 
 
 		 256 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.29 
 
 		 256 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  39.2 
 
 		 250 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  41.63 
 
 		 252 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 250 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 		 249 aa  183  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  29.57 
 
 		 516 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  40.74 
 
 		 251 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 		 250 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  45.99 
 
 		 233 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  26.76 
 
 		 512 aa  182  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  31.45 
 
 		 522 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 256 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  45.45 
 
 		 249 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1873  ABC transporter related  29.2 
 
 		 506 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  26.63 
 
 		 509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  40.73 
 
 		 251 aa  180  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3320  ABC transporter related  45.83 
 
 		 329 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  30.82 
 
 		 511 aa  181  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  28.69 
 
 		 506 aa  181  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  42.17 
 
 		 293 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 251 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  30.43 
 
 		 537 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  42.17 
 
 		 254 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  39.27 
 
 		 255 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  42.28 
 
 		 251 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  43.46 
 
 		 252 aa  180  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3768  ABC transporter related  29.32 
 
 		 514 aa  180  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  28.21 
 
 		 513 aa  180  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4778  ABC transporter related  29.96 
 
 		 524 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  28.14 
 
 		 511 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  41.37 
 
 		 283 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  24.49 
 
 		 501 aa  179  9e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  41.06 
 
 		 249 aa  179  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  30.75 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0993  ABC transporter related  29.35 
 
 		 517 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 260 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 256 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 		 256 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  43.7 
 
 		 593 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  29.96 
 
 		 525 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  41.15 
 
 		 250 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  42.11 
 
 		 256 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  42.91 
 
 		 252 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.27 
 
 		 255 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  43.64 
 
 		 272 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 		 251 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 		 256 aa  178  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  31.87 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  43.28 
 
 		 593 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  41.37 
 
 		 252 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  28.71 
 
 		 504 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  28 
 
 		 513 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>