170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00970 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  100 
 
 
255 aa  494  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  66.39 
 
 
243 aa  262  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  56.97 
 
 
253 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  58.58 
 
 
245 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  57.74 
 
 
333 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  57.38 
 
 
254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  58.33 
 
 
246 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  56.13 
 
 
264 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  57.33 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  39.34 
 
 
222 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  33.62 
 
 
347 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  32.92 
 
 
347 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  33.18 
 
 
237 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  32.73 
 
 
243 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  33.64 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  32.73 
 
 
237 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  32.27 
 
 
236 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  32.35 
 
 
247 aa  106  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  32.23 
 
 
237 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  32.23 
 
 
237 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  32.23 
 
 
237 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  32.23 
 
 
237 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  32.23 
 
 
342 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  30.13 
 
 
255 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  27.73 
 
 
242 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  31.75 
 
 
237 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  27.35 
 
 
242 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  35.86 
 
 
249 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  34.27 
 
 
223 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  31.75 
 
 
237 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  34.48 
 
 
234 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  34.77 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  35.08 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  33.76 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  28.51 
 
 
255 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  31.6 
 
 
234 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  30.95 
 
 
228 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  29.91 
 
 
245 aa  92  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.71 
 
 
258 aa  92  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  32.85 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.62 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  34.27 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  35.4 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  34.31 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.89 
 
 
258 aa  88.6  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  35.43 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  30.63 
 
 
231 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.13 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  30.04 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.33 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  32.74 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  30.43 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  29.36 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  29.36 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  28.94 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  31.8 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  32.08 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  29.96 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.67 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  27.35 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  30 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  28.12 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  29.73 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  35.27 
 
 
239 aa  79  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  28.9 
 
 
308 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  30.33 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  31.17 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  34.42 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  25.91 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  31.62 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  31.93 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  32.19 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  28.75 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  32.72 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  29.44 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  32.72 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  33.93 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  30.63 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  31.42 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  30.67 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  25.73 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  30.08 
 
 
303 aa  72  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  33.48 
 
 
233 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  33.33 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  30.71 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  26.99 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  29.79 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  30.26 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  33.58 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  29.39 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  26.85 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  23.72 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  28.51 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  25.3 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  29.61 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  31.1 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  26.25 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  31.05 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  29.18 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>