158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1312 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 375 aa  746    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  77.33 
 
 		 369 aa  564  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  41.33 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  39.57 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 		 378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  36.44 
 
 		 378 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 		 357 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 		 389 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  33.88 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  37.37 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  37.37 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  33.42 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 400 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 369 aa  145  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.88 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  21.6 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 806 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 388 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  25.54 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 806 aa  60.1  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 802 aa  59.3  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 562 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.64 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  29.55 
 
 		 822 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.47 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  26.4 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.38 
 
 		 557 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 389 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  22.38 
 
 		 473 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 817 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  31.87 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2986  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 447 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.193305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  23.48 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 496 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.64 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0765  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.41 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  21.82 
 
 		 479 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2748  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0267692  normal  0.0112002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  25.27 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 805 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>