More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2269 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2269  tRNA-pseudouridine synthase I  100 
 
 
265 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.584541  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2322  tRNA pseudouridine synthase A  74.32 
 
 
272 aa  359  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2410  tRNA pseudouridine synthase A  74.32 
 
 
272 aa  359  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.293969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1544  tRNA pseudouridine synthase A  74.32 
 
 
272 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  38.93 
 
 
261 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  38.43 
 
 
252 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  34.12 
 
 
258 aa  146  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  34.78 
 
 
248 aa  143  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  32.66 
 
 
244 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  35.04 
 
 
244 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.68 
 
 
245 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0622  tRNA pseudouridine synthase A  31.5 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.939748  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0419  tRNA pseudouridine synthase A  33.46 
 
 
245 aa  135  8e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.293905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.68 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  39.44 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  29.46 
 
 
248 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  29.46 
 
 
248 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  36.88 
 
 
258 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  32.14 
 
 
245 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  32.14 
 
 
245 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  32.67 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  33.07 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  33.07 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  33.07 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  32.14 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  33.07 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.87 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  32.27 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  33.07 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  31.75 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.94 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  32.67 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  31.75 
 
 
245 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  40.38 
 
 
259 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  36.65 
 
 
247 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  32.31 
 
 
252 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  31.87 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  31.75 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  36.86 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  30.98 
 
 
244 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1790  tRNA pseudouridine synthase A  36.92 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  31.3 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  33.73 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  31.35 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  31.35 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  37.9 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  31.35 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1555  tRNA pseudouridine synthase A  36.98 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  32.32 
 
 
259 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  29.88 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  37.11 
 
 
270 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17151  tRNA pseudouridine synthase A  31.37 
 
 
268 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.137278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  34.11 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  34.11 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  35.66 
 
 
271 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  37.93 
 
 
261 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1528  tRNA pseudouridine synthase A  36.23 
 
 
286 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141519  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3767  tRNA pseudouridine synthase A  36.6 
 
 
332 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  36.58 
 
 
247 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 
264 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  32.06 
 
 
247 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  31.42 
 
 
268 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  38.49 
 
 
246 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4942  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.98 
 
 
272 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  33.73 
 
 
252 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  30.08 
 
 
264 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  39.6 
 
 
251 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2159  tRNA pseudouridine synthase A  38.82 
 
 
260 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0844535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1444  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 
257 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1380  tRNA pseudouridine synthase A  34.66 
 
 
243 aa  122  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  39.92 
 
 
278 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  38.65 
 
 
262 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2707  tRNA pseudouridine synthase A  39.58 
 
 
278 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.580118  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0571  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 
255 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  34.34 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  31.6 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2224  tRNA pseudouridine synthase A  39.69 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0737509  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  39.38 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  37.94 
 
 
271 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  29.76 
 
 
245 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34220  tRNA pseudouridine synthase A  36.09 
 
 
288 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3614  tRNA pseudouridine synthase A  36.94 
 
 
264 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421656  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  35.94 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13523  putative tRNA pseudouridine synthase A  33.07 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  37.64 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  37.36 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17411  tRNA pseudouridine synthase A  29.5 
 
 
268 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 
245 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1175  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 
253 aa  119  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.261971  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  35.52 
 
 
250 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0841  tRNA pseudouridine synthase A  34.51 
 
 
305 aa  118  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258098  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  38.19 
 
 
271 aa  118  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  38.19 
 
 
271 aa  118  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  33.46 
 
 
255 aa  118  9e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  39.25 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  38.61 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  34.9 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  34.72 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.999551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>